受气候因素和植被环境控制，川藏铁路很多地区沙漠化严重。在大风季节里会在路基迎风和背风两侧重新堆积形成沙埋以及风蚀现象，产生路基病害。
川藏铁路沿途经过大量国家级或省级自然保护区、风景名胜区、森林公园、地质公园、水源保护区和文物古迹等；沿线地形多半陡峭险峻，水土流失以及土地荒漠化较为严重，生态脆弱、环境敏感 <ref>[http://www.tibet.cn/cn/news/yc/201908/t2 中国的自信与实力 实拍“世界绝无仅有的工程”川藏铁路目前进展]，中国西藏网，2019-08-21</ref> 。
==建设规划==