[[李敖]]曾在2007年前寫文章揭露「登輝和他野父親的關係，李金龍矮矮的，李登輝高高的，兩個人除了都是一樣上男廁之外，其它沒有一點相像。」<ref>李敖，[http://www.taiwanenews.com/doc/20070617101.php 李登輝的身世|李登輝是日本人的兒子]台灣e新聞</ref>。<br>2013年4月，[[監察院]]在網站公佈一份關於[[二二八事件]]的報告，其中[[監察委員]][[周陽山]]、[[李炳南]]對學者[[戚嘉林]]訪談時的逐字稿中，記錄[[世新學]]教授戚嘉林在接受[[監察委員]]訪談時，談到[[謝雪紅]]、[[蔡孝乾]]等[[臺灣共產黨]]人士的事蹟後，突然話鋒一轉，提及李登輝也曾加入過[[中國共產黨]]，「事實上人生不斷在變化，他應該是日本人的[[私生子]]沒有錯」<ref>[https://tw.news.yahoo.com/%E7%9B%A3%E9%99%A2%E5%A0%B1%E5%91%8A-%E6%9D%8E%E7%99%BB%E8%BC%9D%E7%94%9F%E7%88%B6%E6%98%AF%E6%97%A5%E6%9C%AC%E4%BA%BA-213000599.html 監院報告 李登輝生父是日本人]</ref>。這次是李登輝身世之疑，首度出現在台灣官方報告中，但該報告引起台灣各界痛批，後迅速被移除。許多民眾打電話到[[世新大學]]、監察院投訴， [[ 戚嘉林 ]] 只好出面回應，表示自己並非憑空捏造，他只是懷疑而已，認為報告錯誤表達他的語氣，戚對媒體表示「我懷疑可能是，我沒有用肯定句啊，我整個都是用……用疑問句。」輿論質疑監察院所欲何為，根本是妨礙名譽，監察委員[[李炳南]]則表示該報告有些部分稍微偏離了主題。監察委員[[錢林慧君]]直呼太離譜，說：「以前父輩時代不少[[臺灣人]]改成日本姓，不能因李登輝曾用日本姓名，就斷定其生父是日本人。」李登輝辦公室主任[[王燕軍]]暗指批判者是小丑，表示：「沒甚麼回應吧……馬戲團總要有些人出來翻翻跟斗、踩踩氣球……」台灣中視新聞認為監察院將未查證的稗官野史放在公開報告中，「不禁讓人質疑監察院的可信度。」甚至連統派的《中國時報》都批評，不應該隨便指稱別人血統不正。李登輝本人則是回應：「覺得這些人很可憐。對這些有目的的可憐人，會祈禱[[上帝]]赦免他們，讓他們有機會檢討自己。」<ref>{{cite news |url=http://www.bbc.co.uk/zhongwen/trad/china/2013/04/130410_tw_lee_identity.shtml|title=李登輝回應日本人私生子指稱|date=2013-04-10|work=BBC中文網}}</ref><ref>{{cite news |url=http://news.xinhuanet.com/world/2013-04/10/c_124562782.htm|title=李登輝是日本人私生子之謎：曾改名岩裏政男|work=環球時報|date=2013-04-10}}</ref><ref>{{cite news |url=http://video.chinatimes.com/video-bydate-cnt.aspx?cid=1&nid=100724|title=監院報告 李登輝生父是日本人|work=中視新聞|date=2013-04-08}}</ref><ref>{{cite|url=http://big5.huaxia.com/zk/jpwk/zplz/ldhxz003.html|title=李登輝身世之謎|author=[[徐淵濤]]|work=替李登輝卸妝}}</ref>