真核生物在[[进化]]上是[[演化支|单源性]]的，都属于[[域 (生物)|三域系统]]中的''' 真核生物域''' ，另外两个域为同属于原核生物的细菌和古菌。但由于真核生物与古菌在一些生化性质和基因相关性上具有一定相似性，因此有时也将这两者共同归于[[新壁总域]][[演化支]]。