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临终时，孙思邈遗嘱“薄葬，不藏明器，祭去牲牢”，並遗有大量的医书，人尊其為「'''孫藥王'''」。在[[陕西]][[耀县]][[药王山]]（原稱五臺山），有祭祀孫思邈的药王庙{{r|周|page=52}}，并在每年农历[[二月初二]]有「二月二药王庙会」。此外在耀縣還建有「真人祠」、聖母殿與祖塋碑{{r|周|page=52}}。[[宋徽宗]][[崇宁]]二年（1103）[[追封]]'''妙应[[真人]]'''。

== 保生三真人信仰 ==

在[[保生大帝]]信仰中，有所謂的「保生三真人」，認為孫思邈與[[保生大帝|吳夲]]、[[許遜]]在成神之後成了[[結拜]]兄弟{{r|周|page=55}}。在[[廈門]]一帶認為三神排行依序是大哥「金面」孫真人、老二「紅面」吳真人、老三「黑面」許真人{{r|周|page=55}}，但在[[臺灣]]其排行則因地而異{{r|周|page=63}}，[[閭山派]]的廟宇則是依照「玅濟」許真人、「善濟」孫真人、「慈濟」吳真人的順序排列。