相关公司在机组运行管理中，应坚持“安全第一”原则，遵守其《核电厂运行许可证》要求，确保秦山核电厂1号机组、秦山第二核电厂1、2、3、4号机组和秦山第三核电厂1、2号机组运行安全。
==组织结构==
秦山核电站目前共有9台发电机组，总装机容量达到654.6万千瓦。在组织结构上，分为三个实体。
秦山核电站一期的业主为秦山核电公司，该公司的主要股东有中国核工业集团公司（100%）。
一期机组装机容量30万千瓦，1991年12月并网发电。
一期扩建工程2台100万千瓦机组（方家山核电站），为国家4万亿投资项目之一，总投资约460亿。
秦山核电站二期的业主为核电秦山联营有限公司，该公司的主要股东有中国核工业集团公司（50%）、浙江省电力开发公司（20%）、申能股份有限公司（12%）、江苏省国信资产管理集团有限公司（10%）、华东电网有限公司（6%）等。
二期1号机组装机容量60万千瓦，2002年2月并网发电。
二期2号机组装机容量60万千瓦，2004年3月并网发电。
二期3号机组装机容量60万千瓦，2010年10月并网发电。
二期4号机组装机容量60万千瓦，2011年12月并网发电。
秦山核电站三期的业主为秦山第三核电有限公司，该公司的主要股东有中国核工业集团公司（51%）、中国电力投资集团公司（20%）、浙江省电力开发公司（10%）、申能股份有限公司（10%）、江苏省国信资产管理集团有限公司（9%）。
三期1号机组装机容量70万千瓦，2002年11月并网发电。
三期2号机组装机容量70万千瓦，2003年6月并网发电。
==历史价值==