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三军总医院（简称三总），成立于1946年的中华民国军医院.其前身为台湾陆军八○一总医院，组织由台湾陆军医院、联勤第五总医院、陆海空军第一总医院、陆军第一总医院依序递嬗而来。民国56年7月改组为“三军总医院”，由小南门迁建于水源地营区（汀州院区），为我国之军医医疗展开新纪元。
本院编制上属国防医学院之教学医院，负有临床医疗、教学与研究之责，医疗服务对象为现役军人、军眷及一般民众，为卫福部评定之医学中心级教学医院，在国家医疗上一直扮演著非常重要的角色，平时除提供民众医疗服务及国防医学院学生临床教学与实习外，战时还负有动员支援及整合管制医疗资源的任务。
为因应医疗环境快速变迁与寻求军医教育整体发展，本院于民国89年迁建于内湖现址，除保留汀州院区门、急诊服务外，配合国家政策陆续接收澎湖、基隆、松山、北投、台北门诊中心等五个分院，持续提供军民最优质的医疗服务。
内湖总院（含汀州院区）员工约4,000多人，病床数1,900馀床，平均每日门诊约6,000人次。为服务广大病患，本院不断精进诊疗技术及配合各科未来发展重点，持续投资购买先进之仪器设备及提供全人之医疗照护环境，设立有正子断层造影中心、妇女保健中心、血友病防治及研究中心、健康管理中心、高阶医学影像中心、植牙中心、医学美容中心、癌症中心、影像导引断层式放射治疗中心、精准医学暨基因体中心、医用3D列印中心、烧烫伤暨慢性与疤痕照护中心、国际医疗中心、转诊中心、细胞治疗中心、创新育成中心、人工智慧物联网发展中心、亚太伤口负压治疗中心、微量元素研究中心、640列电脑断层中心等，并依医疗任务需求规划电子病历、辐射伤害防治、旅游医学及国际医疗等相关医疗作业，冀能在软、硬体的更新下，提高对国军官兵、眷属及健保民众之医疗服务品质与作业能力。[1]
目录
历史
台湾战后时期，于1946年将“日本台湾陆军病院南门病室”（今台北市立联合医院和平院区与附近地区）改编为台湾陆军医院，以吴国兴上校为院长，并接管日军北投病室。台湾战后时期多次改制，1949年改制为联合勤务总司令部第五总医院。此后医院名称编制更动，1950年改组为陆海空军第一总医院，1955年，改称陆军第一总医院，1960年再改为陆军第八〇一总医院，1967年将北投分院独立为八二一医院。直至1968年5月，改组为“三军总医院”，并由小南门旁迁建至今汀洲院区（原台北市战前规划的大型都会公园之八号公园），与1949年在台复校之国防医学院形成一块完整的教学医院及医学院。 1980年代，国防医学院三军总医院寻求新院区，并选定台北市内湖区原陆军工兵学校校地作为新院区。新建工程于1990年动工，1999年完工，并搬迁至内湖院区。汀洲院区保留门诊和急诊，病房转型为护理之家及呼吸照护病房（RCW）。原汀州院区的闲置土地，成为台北市替代役中心、国立台湾大学水源校区。2000年代国军精实案政策下，2004年收并国军基隆医院为三军总医院附设基隆民众诊疗服务处，一般民众称为“基隆三总”或“三总基隆分院”；2005年收并国军徐州路门诊中心为三军总医院台北门诊中心；2006年收并国军澎湖医院为三军总医院澎湖分院，一般民众称为“澎湖三总”。2013年配合中华民国国防部“医疗机构整合”计划，国军北投医院和国军松山总医院整并入三总为三军总医院北投分院和三军总医院松山分院。2015年1月1日基隆民众诊疗服务处改为三军总医院基隆分院。
人员及编制
三军总医院医师之组成大部分来自于国防医学院医学系毕业生，少部分来自于其他医学院校医学系毕业生。造成此一情况原因是该院医师分为军职及文职，此两种身分的缺额是固定的。但需注意的是，并非军职医师就一定是国防医学院出身，部分非国防医学院出身之军职医师是来自于民间召募医学系毕业之志愿役军官，而军阶停年届满的军职医师也可能转换为文职医师继续聘用。该院院长一般而言为拥有少将军衔之主治医师担任，不再具有国防医学院副院长职衔，而是由该院执行官担任国防医学院副院长职衔。
相较于医师，该院药师、护士、护理师、医检师、放射师、治疗师等虽然亦列为广义之国军人员，但多数为文职身分。值得一提的是，该院早期之勤务员亦多有军职身分（大部分为士官）；然现多数勤务员以外包之人力公司为主，留存下来之老士官已是少数。
分院与院区
三军总医院汀州院区（原三军总医院民众诊疗处）
院址为台北市中正区汀州路三段40号，设有门诊、急诊、住院（仅有急诊留观床、呼吸病房、护理之家），接驳车来往内湖院区。
三军总医院内湖院区
等级为医学中心，院址为台北市内湖区成功路二段325号，设有门诊、急诊、住院，院区内有公车站，并有免费接驳车（来往汀州院区、捷运昆阳站、捷运松山站、基隆分院）。
三军总医院基隆分院（原海军基隆基地医院）
门诊院区
等级为地区医院，院址为台湾省基隆市中正区正荣街100号，设有门诊、急诊、住院，接驳车来往内湖院区。
本院（孝二院区）
院址为台湾省基隆市仁爱区孝二路39号2楼（忠孝大楼），设有门诊。
三军总医院澎湖分院（原海军澎湖基地医院）
等级为地区医院，院址为台湾省澎湖县马公市前寮里90号，设有门诊、急诊、住院，（特殊医疗情况经申请核可）中华民国空军后送。
三军总医院北投分院（原国军北投医院）
等级为地区医院，精神科专科医院，院址为台北市北投区新民路60号精神科专科医院，设有精神科门诊、精神科急诊、精神科住院、家医科门诊。
山下门诊部
三军总医院松山分院（原空军总医院）
等级为区域医院，院址为台北市松山区健康路131号，设有门诊、急诊、住院。