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序列同源性
圖片來自優酷

同源性是序列同源或不同源的一種論斷。兩條蛋白質序列即使沒有統計上顯著的一致性,它們也可能是同源的,同源蛋白總是在三維結構上有顯著的相似性,如果兩條序列有一個共同的進化祖先,那麼它們是同源的。

釋義序列同源性:同源蛋白質的氨基酸序列具有明顯的相似性

同源蛋白質的氨基酸序列具有明顯的相似性,這種相似性稱為序列同源性.具有序列同源性的蛋白質稱為同源蛋白質,同源蛋白共有的相似序列稱為共義序列.

(一)同源蛋白質的物種差異與生物進化

同源蛋白質、細胞色素c系統樹

(二)同源蛋白質具有共同的進化起源

氧合血紅素蛋白質、絲氨酸蛋白酶類

序列的相似性與同源性有什麼區別與聯繫

一、區別

1、概念不同

同源性(homology):進化過程中源於同一祖先的分支之間的關係,同源性是來描述物種之間的進化關係的,所以在同源性的表達中只能用「有」或者「無」,對於有同源性的物種可以描述為「部分同源」或者「完全同源」。

相似性(similarity):是指所檢測的序列與目標序列之間相同的鹼基或氨基酸占整個序列的比例(相對宏觀的一個描述)。在氨基酸序列比對中相似性還包括,除了完全相同的殘基外,在對應位置的兩個殘基是否具有相似的特性,如側鏈基團的大小、電荷性親疏水性等。

比如在氨基酸序列的比對中(以vector NTI為例),完全相同的氨基酸都會被標為黃色,特性相似的氨基酸會被標為綠色。

2、表達方式不同

同源性的表達中只能用「有同源性」或者「無同源性」,對於有同源性的物種可以描述為「部分同源」或者「完全同源」。

相似性可以表達為「兩條序列具有80%的相似性」,表示所檢測的序列與目標序列之間相同的鹼基或氨基酸占整個序列的比例為80%。

二、聯繫

相似性與同源性的氨基酸或核苷酸序列通常有顯著的一致性(identity),如果兩條序列有一個共同的進化祖先,那麼它們是同源的。這裡不存在同源性(homology)的程度問題,兩條序列要麼是同源的要麼是不同源的。

同源性(homology)這個概念不能量化,「兩條序列具有同源性」或者「不具有同源性」。而相似性(similarity)和一致性(identity)可以看作是從不同的角度對同源性的量化指標。

一般地,兩條序列之間的相似性(similarity)的程度會大於一致性(identity)的程度。一般來說,序列之間的相似性(similarity)和一致性(identity)越高,序列之間同源的可能性越大。

擴展資料:

同源性的特性:

同源性是比較生物學中的一個中心概念。同源,最基本的意義就是具有共同祖先。一般來說,如果兩個物種中有兩個性狀(狀態)滿足以下兩個條件中的任意一個,就可以稱這兩個性狀為一對同源性狀:

1、它們與這些物種的祖先類群中所發現的某個性狀相同;

2、它們是具有祖先—後裔關係的不同性狀。

由於進化上或個體發育上的共同來源而呈現的本質上的相似性,但其功能不一定相同,如狗的前肢和鳥的翅。從分子水平講則是指兩個核酸分子核苷酸序列或兩個蛋白質分子的氨基酸序列間的相似程度。

雖然同源性須通過序列測定來檢驗,但是DNA-DNA或DNA-RNA雜交可提供有價值的估計。

視頻

序列比對的重要概念——同源、一致和相似

[1]

參考文獻