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该所前身为1930年成立于南京的的国立中央研究院自然历史博物馆，1934年7月自然历史博物馆改名动植物研究所。日本侵华战争爆发后，动植物研究所多次迁移，先后移至湖南衡山、广西阳朔、重庆北碚。1944年5月，动植物研究所分建为动物研究所和植物研究所，侵华战争结束后又迁入上海。1950年中国科学院成立后，动植物研究所和北平研究院动物研究所的部分研究人员在上海合建水生生物研究所。1954年水生生物研究所迁至武汉。
近年来研究所着力于水环境保护、渔业可持续发展等方面的研究，亦主办《水生生物学报》期刊，是国家斑马鱼资源中心 <ref>[http://www.zfish.cn/Society.html 国家斑马鱼资源中心简介]，国家斑马鱼资源中心 </ref> 的依托机构。
==发展历史==
1952年11月1日，中国科学院第42次院长会议同意水生所及太湖淡水生物研究室迁武汉。
1954年1月，青岛海洋生物研究室独立，更名为中国科学院海洋生物研究室 <ref>[http://www.qdio.cas.cn/2019Ver/Overview/History/ 中国科学院海洋研究所历史沿革]，中国科学院海洋研究所 </ref> （现中国科学院海洋研究所）。
1954年9月，中国科学院水生生物研究所及太湖淡水生物研究室迁往湖北武汉，成为我国以淡水生态学为主的水生生物学研究中心。
<center>中科院水生生物研究所专家</center>
<center>{{#iDisplay:m037594vnim|560|390|qq}}</center>
==参考文献==