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上海科学技术大学是上海市地方高校，筹建于1958年，由中国科学院上海分院负责筹建，1959年正式建校。郭沫若为学校题写校名。首任校长是中科院上海分院副院长周仁。上海科技大学主要科系由中科院在沪各研究所帮助创建，部分系主任曾由中科院在沪研究所所长或副所长兼任。1959年底，设有8个系，11个本科专业。1973年，生物物理化学系并入原华东化工学院。学校原隶属于上海市科学技术委员会，由中国科学院上海分院主办；1968年9月从科技系统（时称上海市革命委员会科学技术组）划出，改为隶属文教系统（时称上海市革命委员会文教组），与中国科学院上海分院脱钩；1978年7月与科技系统恢复联系；1981年划归上海市高等教育局管理，并被确立为上海市属重点大学。1981年11月成为全国首批博士和硕士学位授予单位。1993年底，校园面积约328亩。至1994年，设有12个系（部），23个本科专业，9个专科专业，4个博士点，16个硕士点。末任校长郭本瑜。1994年5月27日并入新组建的上海大学，原校址成为上海大学嘉定校区。