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製藥工程是一個化學、生物學、藥學（中藥學）和工程學交叉的工科類專業，以培養從事藥品研發製造，新工藝、新設備、新品種的開發、放大和設計人才為目標。儘管製藥工程專業在名稱上是新的，但是從學科沿革來看它的產生並不是全新的，是相近專業的延續，也是中國科學技術發展的產物。

簡介

在正式出現製藥工程專業這個名稱以前，國內的高校依據自身的條件已經設置了與此相關的專業，譬如化學製藥專業、中藥學專業、抗菌素專業、精細化工專業、微生物製藥專業等。這些專業有的是設置在醫藥科大學，有些設置在綜合性大學，更多的是設置在理工科大學內。當然，由於主管院校性質的不同，這些專業的側重點也是不同的。從專業面講，新設的製藥工程專業是一個寬口徑的專業，它涉及化學製藥、生物製藥、中藥製藥等領域。

在1998年以前，國內曾經出現過與製藥工程專業類似的專業，譬如抗菌素專業、微生物製藥專業等，這些應該都與製藥工程專業的產生有很大的淵源，原本已有的化學製藥專業當然毫無例外地轉為製藥工程專業。一些醫藥類院校設置有微生物製藥專業，從教育部的歸類來看，該專業應該併入生物工程專業，事實上，一些院校還是選擇了與此更相近的製藥工程專業。1997年，合肥工業大學與安徽中醫學院聯合創辦了五年制製藥工程專業，實行在兩個學校分別學習的制度。這是我國第一個製藥工程專業。合肥工業大學作為製藥工程專業的先驅者，為本專業的發展奠定了基礎。在1998年頒布本科新專業目錄的時候，也就是在製藥工程專業出現於本科專業目錄的同時，在化工類專業中的一個非常熱門的專業——精細化工專業卻從該目錄中消失了。據統計，那時全國至少有174所高校設有精細化工專業，其中有不少精細化工專業都把化學藥物的合成製備作為一個重要的內容。因此，儘管按照新的專業目錄，精細化工專業應以化學工程與工藝專業的名義招生，但事實上還是有相當數量的精細化工專業看準了製藥工程方向，改建成製藥工程專業。

在設置製藥工程專業的初期，能趕上這個節拍的高等院校並不多，主要是一些原來設有化學製藥的工科類大學和原來設有藥學類專業的理科類大學。隨着人們對「藥」這個特殊產品越來越重視，不少高校非常看好這個專業，通過轉型或新建形成了製藥工程專業。

截止到2015年，我國開設製藥工程本科專業的學校從當初的1997年合肥工業大學與安徽中醫學院合辦的第一家，已有近280家，其中屬國家級特色專業的有15家，國家級程師計劃的有15家，通過國際等效工程教育認證的有5家。截至2015年6月，集三者於一身的只有華東理工大學和合肥工業大學製藥工程專業。

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